
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研的结果
探讨工作员探求现在冷库箱时候增长牛羊肉片的坚硬程度、持水、光泽感、悬浮铁分量、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4程度来鉴定胸肌团队人体细胞膜的铁枯死环境。最终信息显示,冷库箱时候增长后,牛羊肉片的坚硬程度在第四天和第6天正相关越来越低;持水功能缩减;红颜色变深,没有光泽感,鲜颜色改成暗颜色。不仅而且,悬浮铁、催化活性氧和MDA的分量正相关上升,人体细胞膜凋亡率正相关增高。 探究考生分离出来多种的要在冷藏室保存日子的肩部肌肉组织合格品的氨基酸质,那么开始SDS-PAGE进行介绍,氨基酸质条带在多种的时间段分布区更加均匀且是类似的(图1a)。利用氨基酸在多种的合格品中的表达爱情形,进行介绍看到相同的组合格品的中数字非常接近于相同的水平方向(图1b),说明书怎么写肩部肌肉组织合格品氨基酸质兼具比较好的组内是类似的性和组间的差女性朋友。 淀粉酶酶质组学共司法检验出1996种淀粉酶酶质。以B0为参考组,建立B1、B2、B4和B6中的淀粉酶酶实行对比探讨表述出形式探讨,共司法检验到37七个DEPs。将火山图多维定性分析,并表明FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个规格探讨DEP。结论如下图如图1c-f如图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别司法检验出22、33、73和140个DEPs,在当中分发型别上涨6、11、32和86个,再降16、22、41和5两个。聚类分析法形式鉴定了各个保鲜时候段背部脂肪结构中淀粉酶酶质的表述出形式,结论表示背部脂肪淀粉酶酶表述出形式对比探讨现在处理时候的加大而加大(图1g)。
图1| 不同的冷冻箱准确时间的背部肌肉原辅料蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 区别要在冷藏室保存时的背部肌肉土样不同蛋清分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消亡蛋白酶肽的PRM一定量剖析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 体系结构KEGG聚集地域差异表达出蛋白酶的铁伤亡策略(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT降钙素原检测淀粉酶质组学技术设备性保障,拜谱生物体已生产制造进行并实现了建全发育成熟的转录组学、淀粉酶组学、分泌组学甚至多个学结合软件技术设备性保障指标体系,欢迎致电咨询!
关联性资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.