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(J. Agric. Food Chem.)|探究S-亚硝基化对Caspase-3修饰和肌纤维蛋白降解的影响

发布时间:2024-11-15
肉的宰后嫩化核心归因于肌原化学合成纤维素空间结构类型的破碎,肌原化学合成纤维素空间结构类型是由内源性核蛋清质酶溶解酶化学降解塑料肌原化学合成纤维素和受损細胞核骨架核蛋清质酶从而造成的。与一百多年来一直以来都是了解大家都讨论的钙核蛋清质酶酶有差异 ,胱天核蛋清质酶酶(caspases)最近几天变成感喜好话题。胱天核蛋清质酶酶在受损細胞核凋亡的执行命令的阶段起着至关核心的用,在这其中caspase-3在死去核蛋清质酶溶解中的用是双管理方面和繁杂的,所以直得进这一步的探析。S-亚硝基化按照上变动整钙移除、能量消耗排泄、核蛋清质酶质化学降解塑料和受损細胞核凋亡来上变动整肉肥,比如嫩度和持水程度。先期的探析发展S-亚硝基化应该变动依赖感线粒体的caspase-3级联不起作用,这能够是相关肌肉受损細胞核凋亡和鸡肉品行变换的其原因。caspase-3的的探析核心是其与受损細胞核凋亡的社会关系,因此,越来越多有的探析试论S-亚硝基化上变动整caspase-3的制度化。

2024年9月由武汉占农业的大部分本科大学张万刚专家公司在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱怪物为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。

中文名网站标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响

杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry

202历经四年不良影响系数:5.7

发布准确时间:2024年9月

朋友机构:南京农业大学

探讨用料:蛋白

拜谱具备工艺:亚硝基化修饰组学

工艺路经:

一、分析报告单

01.Caspase-3特异性

现在尚不非常清楚NO对caspase-3的抑制造用功效有无归因于NO介导的S-亚硝基化,的不同氧化还原电位均值的GSNO成为外源性NO批售,以诱导性caspase-3的离体S-亚硝基化。报告单取决于,与不GSNO的组好于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力性明显调低(图1),与事先了解相同。GSNO处置调低caspase-3活力性的暗藏病因仍尚待指出。

图1 区别密度的GSNO解决对caspase-3几丁质酶的危害

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

02.Caspase-3的S-亚硝基化程度上

论述Caspase-3的亚硝基化系数,以确立GSNO对Caspase-3的症状性。经GSNO治理后,判断到caspase-3核蛋白S-亚硝基化抗弯强度新增(图2)。哪些没想到呈现,外源性GSNO激发可顺利引发caspase-3的离体S-亚硝基化。惹人诧异的是,在未GSNO会出现的比组中判断到同一个很弱的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3有机会会发生内源性的S-亚硝基化。凡此种种,本论述中caspase-3的S-亚硝基化系数较高,而caspase-3的活性酶大幅度降低,这与此前的论述同样。但是,caspase-3的非特异朋友S-亚硝基化绘制位点尚不了解,还需进第一步的探险。

图2 GSNO治疗对caspase-3S-亚硝基化水平面的印象

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

03.Caspase-3的S-亚硝基化位点

通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。

图 3 caspase-3的编码字段。浅蓝色标识的编码字段表现S-亚硝基化肽,橘红色标识的C表现S-亚硝基化半胱氨酸

(图源:Hou, Qin et al., JAgric Food Chem.. 2024)

图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

04.S-亚硝基化Caspase-3化学降解结核蛋白

结血清酶酶质对于有一种主要的受损体细胞骨架血清酶酶质,在稳定肌受损体细胞构造的构造完善性和缩紧性管理方面起着主要的作用,学习S-亚硝基化caspase-3对结血清酶酶质生物吸附的敏感脆弱性有主要实际意义。与Std(未用胱天血清酶酶质酶-3和GSNO孵育的默认肌植物纤维板血清酶酶质)组优于,0 μM GSNO组(肌原植物纤维板和caspase-3的孵育,无GSNO)的完善结血清酶酶质水分含锌量偏态变低,表达caspase-3对结血清酶酶质有意向的血清酶酶质球淀粉酶质质水解实力。在GSNO孵育后,完善结血清酶酶质的水分含锌量显眼增添(P < 0.05)。还有,当GSNO氨水浓度增大时,完善结血清酶酶质的水分含锌量连续上浮(P < 0.05)(图5)。某些看到表达,SNO体现的caspase-3以品质根据的手段遏制结血清酶酶质的生物吸附。

图5.S-亚硝基化caspase-3分解结蛋清

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙蛋白质-T

肌钙血清质-T (TnT)是原肌球血清质调结责任人相关肌肉回缩的丝条的须得肌原弹性仟维血清质。TnT的溶解特性是监测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化水平下,caspase-3对TnT的溶解具体情况如6表达,与Std组(没含caspase-3和GSNO的肌原弹性仟维)相对来说,caspase-3组中30 kDa TnT段落同质性不断增加,反映出caspase-3加入了TnT的溶解,除外,caspase-3与GSNO的孵育引起30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组彼此都没有监测到非常明显的一定的差异(P > 0.05),而当GSNO的酸度达标400 μM 时,该段落同质性限制(P < 0.05)。此类知道反映出了SNO遮盖的caspase-3对TnT溶解的应该抑制做用。结血清质和TnT是caspase-3的的敏感底物,而GSNO处里变低caspase-3的活力性酶也许 引起肌原弹性仟维血清质溶解地步变低。上述情况上述一系列的,NO成脂的S-亚硝基化应该确认遮盖半胱氨酸残基来调结caspase-3的活力性酶,而能进每一步反应其对结血清质和TnT的血清质淀粉水解力,得以反应牛羊肉品行。

图6. S-亚硝基化caspase- 3分解肌钙蛋清-T

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

二、总结ppt

本深入分析最后初探S-亚硝基化对caspase-3装饰的直接导致试述那么对牛肉片片肌原人造仟维离体吸附的直接导致。核球蛋白酶S-亚硝基化可能装饰caspase-3的半胱氨酸残基,最后导致caspase-3抗逆性较低,进一歩能够抑制了其对牛肉片片肌原人造仟维核球蛋白酶的核球蛋白酶蛋白质水解特性。

三、拜谱工作小结

科学研究方案所采用了酶活检验,亚硝基化突显组学了解,WB等探测具体方法,显示蛋清S-亚硝基化会突显caspase-3的半胱氨酸残基,这促使了caspase-3特异性的降底,齐头并进一个步骤可以抑制了其对羊肉肌原黏胶纤维蛋清的蛋清溶解学习能力。本科学研究方案为诠释蛋清质亚硝基化对口感的控制共识机制出具好几个个新的视野。

拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球蛋白酶质组学、表达球蛋白酶质组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系软件,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total脱色还原系统、游离于巯基,欢迎大家咨询!

对比论文资料:

Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663
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