
近日,长沙医科综合大学一是附设青岛博士整形医院医院王学浩博士团队协作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗势能分解检测分析服务。
英文怎么说子标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版标题文字:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
买家部门:南京医科大学
论述板材:细胞
拜谱提高服务项目:转录组测序+蛋清互作组+靶向治疗激光能量消化吸收组
高技术路线地图:
研究方案没想到
01、YBX1被鉴定会为HCC中糖酵解的最为关键的dna
本研究探讨参数采集HCC癌肿样品(n=7)的单血内部RNA测序参数集使用介绍,知道糖酵解活性酶类常见集中授课在癌肿血内部中,hdWGCNA介绍认别出9个什么是基因控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的荒岛荒岛生存介绍判定YBX1为独立的荒岛荒岛生存可能性关键因素(图1H)。进步骤运用IHC、WB實驗和癌肿集体安排与附近非癌肿集体安排的的空间转录组学参数集证明YBX1是肝血内部癌开展的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被知道为调控HCC细胞核糖酵解的要素情况
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点人体脂肪分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1综合并增强YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合起来并推进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化改善其磷过酸,进而加速其核转位
进一部验测YBX1的O-GlcNAc糖基化是的影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC細胞中或用OGT能够抑药物OSMI-1整理,YBX1蛋清横向明显消减,YBX1磷硝化作用明显限制(图4A-C)。IP研究表现,在同等的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷硝化作用横向明显远远超出YBX1-T57A,阐明磷硝化作用的添加一方面仅是可能更强的YBX1蛋清形容(图4D)。溶合了核和质多组分察觉到了TMG整理的HCC細胞中YBX1核形容的提升(图4E-F),进一部察觉到了YBX1磷硝化作用的重点自动调节细胞是AKT(图4G-I)。这察觉到了反复强调O-GlcNAc糖基化按照带动其磷硝化作用来提升YBX1蛋清固明确并带动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有弊于其进几步进行磷过酸淡化并就能促使其核转位
05、YBX1增进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促使PKM2转录
06、YBX1 也能从而提高组血清乳硝化作用装饰情况
的研究感觉YBX1敲低明显变低淀粉酶质乳硝凝成用,特别是在是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解仰制性剂2-DG的实验报告断定了糖酵解与组淀粉酶乳硝凝成用的马上关系,仰制性糖酵解可明显变低H3K18la平行(图6D)。PKM2过传达可逆反应转YBX1敲低所导致的的H3K18la下跌,以外源乳酸加工处理不禁不断提升H3K18la,还跟随YBX1传达调涨,显示存有正在向返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la确认聚集于YBX1进行子马上力促其转录,该时候受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),并感觉P300 调涨是YBX1怎强H3K18乳酰凝成用的长效机制(图6K-L)。
图6.YBX1提高H3K18乳碱化体现横向
好的文章总结
在这种种的研究中新闻稿件了YBX1在HCC中高展现出,然后与糖酵解谜切关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,然而稳固氨基酸质并加大其展现出。这种种绘制还催进YBX1在T57处的磷酸性反应,催进其核易位。对此,这种方式加强了糖酵解关联染色体的转录并刺激作用乳酸的导致。不仅而且,YBX1提高P300的转录,继而驱程组氨基酸的乳酸性反应,非常是H3K18la,H3K18乳酸性反应朝调节管控YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正反面馈环措施图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向药物精力基础代谢组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻译工作后绘制组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考资料期刊论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.