草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿模式的最易见的患病产品之一。肾聚集中CaOx晶胞过过剩沉淀会以至于肾小管细胞核挤压伤和凋亡，引发以至于肾结石的转变成。短链多余脂肪含量酸由肠子内活性污泥日常细菌发醇营养健康食物纤维产生了，实际上在不规则肠子障壁中产生出来用，况且在模式的情况上也产生出来重要的用。进来，丁酸是最充裕的短链多余脂肪含量酸，兼有抗感染和免疫抗体治理和改善用,本探究一起探讨丁酸对CaOx肾结石的用名词解释未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山三甲医院泌尿产科吴忠副教授、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠先生、周子健博土在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物工程与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网咯药学学提供服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

小文章名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客服方：华山医生 探究项目：大鼠、HK-2生殖细胞 排列资料：对应组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示 枝术：wifi网络药剂学学探测

基本思路工艺流程

探究没想到

探究方案人工1共建大鼠模特，顺利通过生理方面血生化的指标和安排病理学学固色等探究方案有效途径察觉到丁酸能否缩减CaOx模特大鼠肾CaOx结晶的进行和挤压伤，减少CaOx模特大鼠的支原体感染挤压伤和脱色有机化合物的优化描述。不仅，丁酸还可压制草酸引导的HK-2神经上皮细胞挤压伤、脱色应激状态和神经上皮细胞凋亡。 为与探讨丁酸成分和靶遗传DNA遗传组wifi在线，论述成员从PubChem提高丁酸和丁酸酯的二维和三维空间成分（图1A）。确定PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库整理后共需求出1115个丁酸靶遗传DNA遗传组供进那步分折。将遗传DNA遗传组详细完整信息接入STRING统计资料库，确定PPIwifi在线分折。Cytoscape给定了排顺的前20的交通联络线靶遗传DNA遗传组的详细完整wifi在线图，最核心的包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样交通联络线遗传DNA遗传组与wifi在线中的的遗传DNA遗传组均症状出千万的各种相应性了解，体现了这样遗传DNA遗传组有也许 表现着协同工效用途。GO和KEGG分折阐释了丁酸交通联络线遗传DNA遗传组的各种相应有效条件和生物工程体学技能（图1C）。交通联络线遗传DNA遗传组最核心的与类固醇的生长激素回话、腐蚀应激状态状态回话、渗透性氧上皮细胞对类固醇的生长激素激发的效用还有对酸碱性化学上有害物质的效用关于 。结合以上体现了，这样交通联络线遗传DNA遗传组最核心的参予了腐蚀应激状态状态和对渗透性氧的生物工程体效用全过程，是肾结石构成策略中至关为决定性的有效条件，这体现了丁酸有也许 在肾结石中表现为决定性用途。

图1| 丁酸机构与靶遗传基因电脑网络分折(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步探寻丁酸对CaOx肾结石真是切靶遗传dna组，钻研人灵活运用GEO数据文件库文件库对GSE73680中健康保健比与CaOx肾结石病员的遗传dna组差别的判断了钻研。比组与CaOx结石病员的为明显能力差别的展示遗传dna组（DEGs）肿瘤筛查标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个遗传dna组时有发生为明显发生改变，各举3379个（89.4%）遗传dna组展示上浮，404个（10.6%）遗传dna组展示下降（图2A）。对DEGs判断聚类算法算法探究，热图表明了前10个被选中DEGs的二维分块聚类算法算法基本特征（图2B）。继而，钻研人确认GeneCards数据文件库文件库人工成本签定了370个可以与CaOx肾结石有关的内容的遗传dna组，名列前20位的估计遗传dna组还有其有关的内容性评分标准如2C如图。成了寻得丁酸开展治疗CaOx肾结石的主要靶点，钻研人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的内容遗传dna组治理 收获新一个Venn图。结果英文，CYP2C9被判断为丁酸影响到CaOx肾结石的未知靶点(图2D)。不仅而且，钻研人还判断了丁酸与CYP2C9的氧分子联接，CYP2C9的以下三个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸上下级影响，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采取互联网药学学予测CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶基因遗传后，的研究人员管理还借助体神经细胞实验所表明了CYP2C9可大幅度降低草酸诱骗的HK-2体神经细胞的ROS水平面、宫颈炎症神经损伤和凋亡。

图2| 普遍据库联办介绍預测CYP2C9是丁酸效果于CaOx肾结石的靶遗传基因

的研究可是

本深入分析第一方面得知丁酸在体內和体內均能可以减弱CaOx肾结石模板的空气硫化应激状态状态和细菌感染断裂，陆陆续续实现电脑电脑网络临床药学学选择获得丁酸的影响CaOx肾结石的不确定靶点——CYP2C9，另外实现上皮组织科学试验阐明CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2上皮组织ROS横向、细菌感染断裂和凋亡。某种些得知阐明丁酸机会实现可以减弱CYP2C9来可以减弱CaOx肾结石的空气硫化应激状态状态，减缓细菌感染断裂。某种的时候中拜谱生物技术工艺技术工艺应用保证了电脑电脑网络临床药学学技术工艺应用提供贴心服务，凡此种种拜谱生物技术工艺技术工艺应用可上升旺盛期落实的人类基因组学、蛋白酶质组学、代谢转化组学等两组学厂品及技术工艺应用提供贴心服务，欢迎会致電询问！ 基准资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.