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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一种将成为化工机械奶茶原料而被熟悉的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“基础代谢有害垃圾”将成为“宝藏地图小大分子”的坚辛发展历程类似于,终究会近几十年才被看见其首要的生态学学效果,从“平躺农奴把合唱”,特备是在免疫抗体宫颈慢性炎症性症状科学研究层面内与时共进。以有多页参考文献通讯稿了在不同宫颈慢性炎症性症状的小动物3d模型中带来衣康酸或其化学式呈现繁衍态学的治疗方法益处,并看见其内在靶点。有关于衣康酸的“上一世”与“这辈子”,具体情况见软文《乳酸的逆襲哥们——衣康酸!这篇让你掌握衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化呈现血清组学产品,实现1000+高妙度突显位点查出,稳定性复现特色靶点,全地方生信分折解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“印证”全步奏服务的,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、實驗的流程

02、实际数据统计

03、经“点”重演

在评测数据信息中,验出多论文参考文献中新闻稿的经点靶点和其衣康酸呈现位点,如1、个被发掘的衣康酸共价呈现血清KEAP1,有着糖酵解信号通路中的3个重要的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,和炎性小体组合而成血清NLRP3和细胞系挫裂环节中的重要的血清RIPK3等,其质谱图有以下图如图。

04、厂品特别

1.多厚质控

工业化特女性朋友探头孵育、SDS-PAGE检查测量、WB印证、样品想关性分享等多多位检查测量,抓好建设项目结杲安全性。

2.高机械性能质谱医疗仪器游戏平台

在Orbitrap Astral全新一带高判别质谱仪六道金刚咒下,建立衣康碱化表达位点及蛋清鉴别新深度1,电子助力科学合理的研究科学新发现。

3.全方法一趟式业务

依托于拜谱生态学健全完善的检侧品台,可提供数据“内部培养出来→测试探针孵育→WB检侧→深奥度衣康碱化呈现检侧→属于生信定量分析→既定位点PRM查证”全程序精准服务,省时贴心更贴心。

05、定性分析资源(个部分)

06、拜谱生物位置

PART 2、文献综述安利

论文参考文献一

英文版标题格式:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

繁体中文问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

科研资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

参考文献二

因为网站标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文字幕子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

学习网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典型案例诞生工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13极具弱于的底物根据实力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康碱化遮盖组场地实测数据库中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用装饰(正确图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

作为一个TCA配置中的两边分解产生物,衣康酸调试分解产生、天然天然天然免疫和妇科发病内的互为的作用,为治療天然天然天然免疫妇科发病性妇科发病具备了代替治療政策。衣康酸格局中的亲电性α,β-不饱和点羧酸格局能对蛋清质上的几丁质酶半胱氨酸残基实施烷基化掩盖(迈克尔加的反映),一项讲述后掩盖被称做“衣康酸掩盖(itaconation)”,以求决定蛋清质功能键,调节天然天然天然免疫回话和分解产生途经,为四种妇科发病药材产品开发具备新工作思路。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究一定参考值靶向治疗细胞代谢组(QMT1000)或消耗的能量分解新陈代谢靶向疗法分解新陈代谢组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考价值医学文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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